Ekstrakurikuler Kelompok Ilmiah Remaja (KIR) di MANU Putri Buntet Pesantren merupakan wadah bagi siswi untuk mengembangkan pola pikir kritis, kreatif, dan sistematis dalam bidang keilmuan. Melalui KIR, siswi dilatih menguasai metodologi penelitian ilmiah, mulai dari identifikasi masalah, pengumpulan dan analisis data, hingga penulisan Karya Tulis Ilmiah (KTI) yang logis dan terstruktur. Ekskul ini mendorong siswi untuk menjadi peneliti muda yang peka terhadap gejala alam dan sosial, serta aktif berpartisipasi dalam ajang kompetisi riset, sehingga menjadi fondasi kuat bagi siswi yang ingin melanjutkan studi di bidang sains, teknologi, maupun ilmu sosial.